满清的君臣礼仪繁琐，尤其是跪拜等礼仪让沙俄难以接受。双方就递交国书、觐见礼仪等反复谈判，仍无法达成共识。

在对待俄罗斯方面，满清政府的态度是傲慢的。他们认为俄国是归化中国的外夷，应视同为藩属国，因此拒绝了中俄建立平等国交的要求，驱逐了沙俄使团并回了一封致沙皇的诏书。顺治帝在诏书中以“谕鄂罗斯国察干汗”起头，正文中则称“今尔诚心向化，遣使进贡方物，朕甚嘉之，特颁恩赐，即俾尔使人赍回，昭朕柔远至意。尔其钦承，永劾忠顺，以副恩宠。”

沙俄与满清邦交受挫之后，开始不断蚕食中国东北边境，先后占领雅克萨、尼布楚等地。

雅克萨是中国东北边疆的一座古城，位于黑龙江上游左岸，位于今漠河市境内，地扼水陆要冲。

尼布楚则是今俄罗斯外贝加尔边疆的一个城市，南邻蒙古国，东邻中国内蒙古自治区。

公元1673年，沙俄再次遣使来华，就礼仪问题上再次纠缠不清。康熙帝允许使团进京谈判，以解决沙俄侵犯边境的问题。双方采取了一种折中的办法。在紫禁城午门外铺设一张黄案，将俄国国书放在黄案上，再由大学士转交皇帝。而沙俄使者也做出让步，向康熙帝行跪拜礼。

这次会面并未解决边境上的实质问题，但让康熙帝发现沙俄或有对抗满清的实力，随即在黑龙江一带增派重兵驻边。

公元1683年9月，康熙帝在平定三藩、收复台湾后，腾出手来处理北境问题。他向沙俄提出抗议，勒令盘踞在雅克萨地区的沙俄军队撤离清朝领土。

沙俄军的回应是，起兵至爱珲（今黑龙江爱辉县）一带劫掠。

这一次，满清政府没有惯着沙俄军队，起兵打败他们后，一把火将黑龙江下游沙俄军的据点全部烧毁，使雅克萨成为一座孤城。

满清与沙俄之间的邦交互信至此被全部剥离。经过多次交涉、警告未果后，康熙帝意识到只有使用武力才能驱逐沙俄侵略军。